NCBI简介及序列编号说明

一：

NCBI

简介

NCBI

的

GenBank

与

DDBJ(DNA Data Bank of Japan)

、

EMBL

的

EBI

数据库共同组成国际

DNA

数据库，每日都交换更新数据和信息，并主持两个国际年会－国际

DNA

数据库咨询会议和国

际

DNA

数据库协作会议，互相交换信息，因此三个库的数据实际上是相同的。

GenBank 

有来自于

70,000

多种生物的核苷酸序列。

每条纪录都有编码区

（

CDS

）

特征的注

释，还包括氨基酸的翻译。

（

是美国国家生物技术信息中心

(National Center for Biotechnology Information 

，

NCBI)

建立的

DNA

序列数据

库，从公共资源中获取序列数据，主要是科研人员直接提供或来源于大规模基因组测序计划

( Benson

等，

1998)

。

Entrez 

是美国国家生物技术信息中

心所提供的在线资源检索器。该资源将

GenBank

序列与其原始文献出处链接在一起。

Entrez 

是由

NCBI

主持的一个数据库检索系统

。它包括核酸，蛋

白以及

Medline

文摘数据库，在这三个数据库中建立了非常完善的联系。因此，可以从一个

DNA

序列查询到蛋白产物以及相关文献，而且，每个条目

均有一个类邻（

neighboring

）信息，给出与查询条目接近的信息。

）

DDBJ

主要向研究者收集

DNA

序列信息并赋予其数据存取号，信息来源主要是日本的研究

机构，亦接受其他国家呈递的序列。

EBI

的主要任务：

⑴为科学界建立和维护生物学数据库，

提供免费的数据和生物信息服务，

支持生物学数据的存储和挖掘，

促进科技进步；

⑵通过生物信息学的基础研究继续推动生物学

发展；

⑶为各个层次的科学工作者提供生物信息学培训；

⑷支持帮助边缘尖端科技成果向工业

界的转化；⑸协调欧洲生物数据的提供。

RefSeq

是

NCBI

数据库的参考序列。

RefSeq

资料库是

NCBI

将

GenBank

的序列再做详细整

理的

non

-

redundent

序列资料库，它的序列格式和

GenBank

几乎完全相同，但因为是完全不同

的独立资料库

,

为与

GenBank

区别，

RefSeq

的

Accession Number

格式和

GenBank

不同。